Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM42Q9BTD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms