Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGPAT1Q99943 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGPAT1Q99943 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms