Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS8Q99627 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS8Q99627 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms