Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1AQ96P16 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1AQ96P16 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms