Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD27Q96NW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms