Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC138Q96M89 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms