Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC114Q96M63 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC114Q96M63 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms