Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT74Q96LB3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms