Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms