Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms