Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DCHS1Q96JQ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms