Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HHIPL1Q96JK4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHIPL1Q96JK4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms