Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms