Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALML4Q96GE6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms