Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102AQ96A19 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms