Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms