Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCE1Q969G3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms