Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms