Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms