Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPBAR1Q8TDU6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms