Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL2Q8NHH9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms