Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FSIP1Q8NA03 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms