Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBP4Q8N2S1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP4Q8N2S1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP4Q8N2S1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP4Q8N2S1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP4Q8N2S1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP4Q8N2S1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBP4Q8N2S1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms