Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-207ENST00000518397 830 ntTSL 58.85□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-226ENST00000612301 502 nt8.85□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-212ENST00000459966 627 ntTSL 28.74□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-204ENST00000546562 627 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.025e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 58.55□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LRP8-208ENST00000475501 721 ntTSL 38.37□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 58.19□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BMS1P1-201ENST00000374336 1332 ntBASIC8.11□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CLYBL-201ENST00000339105 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PHYKPL-215ENST00000510913 643 ntTSL 37.93□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 37.89□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF621-205ENST00000453351 565 ntTSL 47.89□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 47.89□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPAG9-216ENST00000513827 728 ntTSL 27.86□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-210ENST00000454563 558 ntTSL 47.8□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SMYD3-208ENST00000464398 540 ntTSL 37.77□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-224ENST00000512140 2876 ntTSL 27.77□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.185e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH3-203ENST00000504239 455 ntTSL 37.68□□□□□ -1.185e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-212ENST00000450756 590 ntTSL 47.57□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBC1D14-203ENST00000427736 541 ntTSL 27.55□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.215e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 37.51□□□□□ -1.215e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-213ENST00000466197 640 ntTSL 57.43□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 27.38□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-201ENST00000415397 1890 ntTSL 57.34□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 47.32□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-205ENST00000412691 586 ntTSL 47.29□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-225ENST00000569400 802 ntTSL 47.29□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NIPSNAP2-206ENST00000456204 660 ntTSL 37.17□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-214ENST00000454473 3005 ntTSL 57.1□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 27.04□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ARID1B-206ENST00000452544 4443 ntTSL 26.9□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LARS2-206ENST00000467936 804 ntTSL 46.86□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-205ENST00000418329 2912 ntTSL 56.86□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-211ENST00000548880 577 ntTSL 26.85□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 56.83□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 36.81□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 56.77□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 COPA-207ENST00000545284 879 ntTSL 26.72□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-211ENST00000441656 2899 ntTSL 56.71□□□□□ -1.345e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RIMKLB-210ENST00000541044 555 ntTSL 36.62□□□□□ -1.355e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.355e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.375e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PIP4K2A-208ENST00000605011 558 ntTSL 46.5□□□□□ -1.375e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.44□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.44□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 36.44□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HACD2-203ENST00000471236 403 ntTSL 36.4□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 56.4□□□□□ -1.387e-14■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPAG9-204ENST00000505173 2369 ntTSL 56.29□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 METTL6-206ENST00000458728 564 ntTSL 36.28□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-204ENST00000373820 2358 ntTSL 26.15□□□□□ -1.435e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-208ENST00000580038 2033 ntTSL 56.11□□□□□ -1.435e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.445e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.445e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-209ENST00000519439 658 ntTSL 36.04□□□□□ -1.445e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-210ENST00000432618 956 ntTSL 46.02□□□□□ -1.455e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.455e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.455e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LIG3-206ENST00000586058 581 ntTSL 25.94□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-224ENST00000610321 4930 ntTSL 55.69□□□□□ -1.55e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-203ENST00000577552 912 ntTSL 55.65□□□□□ -1.55e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 API5-204ENST00000526394 883 ntTSL 55.63□□□□□ -1.515e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.525e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADNP2-205ENST00000561195 124 ntTSL 35.58□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.535e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-208ENST00000428808 754 ntTSL 45.48□□□□□ -1.535e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 DENND4A-204ENST00000562028 481 ntTSL 35.42□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 55.42□□□□□ -1.541e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-222ENST00000524099 569 ntTSL 45.41□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 81.8
Retrieved 100 of 12,391 protein–RNA pairs in 181.9 ms