Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT9Q86SS6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms