Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM72Q6ZMU5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM72Q6ZMU5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms