Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BLOC1S2Q6QNY1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms