Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms