Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC41PQ6P2S7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms