Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFSP1Q6NVU6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFSP1Q6NVU6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms