Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TYW3Q6IPR3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms