Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT39Q6A163 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT39Q6A163 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms