Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms