Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCH4

CYP4A22, Cytochrome P450 4A22, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A22Q5TCH4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A22Q5TCH4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A22Q5TCH4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms