Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HSP90AB3PQ58FF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSP90AB3PQ58FF7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms