Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4L6Q3SYB3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L6Q3SYB3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms