Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms