Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TYSND1Q2T9J0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms