Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KNOP1Q1ED39 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms