Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1AQ16623 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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