Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VPS72Q15906 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS72Q15906 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS72Q15906 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS72Q15906 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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