Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP6AP1Q15904 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP6AP1Q15904 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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