Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3CQ15386 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3CQ15386 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
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