Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRKQ15262 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
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