Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF6Q15052 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF6Q15052 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms