Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KARSQ15046 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KARSQ15046 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KARSQ15046 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KARSQ15046 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KARSQ15046 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KARSQ15046 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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