Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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