Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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CDH18Q13634 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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