Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL2Q13617 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms