Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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